马英九宣布请辞国民党主席之后，继任人选成为烫手山芋。据台湾媒体报道，台湾地区副领导人、国民党副主席吴敦义经过党内的全力慰留，终于同意将代行主席职务，办理新一届的党主席选举。吴敦义作为国民党副主席中资格最老的一位，此前就被认为是接班第一人选，但在国民党"老人"日益令人厌倦的情况下，早已多次流露退意。
因此，虽然暂时找到了负责人，国民党的继承危机仍然没有过去。为负起全台22县市九合一选举国民党只保留6县市执政的败选责任，马英九昨天下午正式宣布将辞去党主席职务，并呼吁吴敦义留任副主席。
据台湾媒体报道，马吴两人还进行了单独讨论，台湾地区副领导人吴敦义基于党内团结，最后同意将留任到新党主席选出为止，等于他仍是暂时代理的党主席，由他来办理新一届的党主席选举。其实，吴敦义12月1日中午就表态请辞副主席，2日上午表明不会参选党主席。
